Насчет 2х лет для LIon аккумов читал тоже (мол, портятся, даже если только хранятся). Но практика показывает иное. Скорее всего, там речь просто о гарантии работы шла, т.е. через два года кому как повезет. (а везет многим:) )
Насчет глубокого разряда - тоже была инфа, что постоянно доводить девайс до самовыключения вредно. Кстати, там же было утверждение, что перезаряд литиевым аккумам даже полезен, т.е. добирают емкость даже после того, как индикатор покажет 100%. А встроенный контроль не позволит им "рвануть"

Но в то же время, часто оставлять на ночь тоже вредно. Проверить сложно - от самовыключения емкость уменьшилась или от времени. Например, когда я GPRS-ом частенько сажал батареи на МЕ45, емкость упала. Но с другой стороны, ему уже полтора года, в принципе, пора. Так что однозначного ответа нет (или, у кого есть статистические данные - поделитесь)
Я свои девайсы заряжаю примерно с 15-25%. На ночь ставлю когда как - если не успели зарядиться до моего крепкого сна;)